Учени, работещи върху чревния микробиом, откриха и изолираха повече от 100 напълно нови вида бактерии от червата на здрави хора. Изследването на Wellcome Sanger Institute, Hudson Institute of Medical Research, Австралия и Европейския институт по биоинформатика на EMBL създаде най-изчерпателната колекция от човешки чревни бактерии досега. Това ще помогне на изследователите по целия свят да проучат как нашият микробиом ни поддържа здрави и ролята му в болестите.
Докладвано днес (4 февруари) в Nature Biotechnology, новият ресурс ще позволи на учените да открият кои бактерии присъстват в човешките черва, по-точно и по-бързо от всякога. Това също ще осигури основата за разработване на нови начини за лечение на заболявания като стомашно-чревни разстройства, инфекции и имунни състояния.
Около 2% от телесното тегло на човек се дължи на бактерии, а чревният микробиом е основно бактериално място и основен принос за човешкото здраве. Дисбалансите в чревната ни микробиома могат да допринесат за заболявания и сложни състояния като възпалително заболяване на червата, алергии при синдром на раздразненото черво и затлъстяване. Въпреки това, тъй като много видове чревни бактерии са изключително трудни за отглеждане в лабораторията, има огромна празнина в познанията ни за тях.
В това проучване изследователите изследваха фекални проби от 20 души от Обединеното кралство и Канада и успешно отглеждат и ДНК секвенират 737 отделни бактериални щама от тях. Анализът на тези изолати разкрива 273 отделни бактериални вида, включително 173, които никога преди това не са били секвенирани. От тях 105 вида дори не са били изолирани преди.
Д-р Самюел Форстър, първият автор на статията от Wellcome Sanger Institute и Hudson Institute of Medical Research, Австралия, каза: „Това проучване доведе до създаването на най-голямата и най-изчерпателна публична база данни за човешкото здраве- свързани чревни бактерии. Чревният микробиом играе важна роля за здравето и болестите. Този важен ресурс ще промени фундаментално начина, по който изследователите изучават микробиома."
Стандартните методи за разбиране как чревният микробиом въздейства върху човешкото здраве включва секвениране на ДНК от смесени проби от чревни бактерии, за да се опита да разбере всеки компонент. Тези изследвания обаче са силно затруднени от липсата на индивидуално изолирани бактерии и референтни геноми от тях.
Новата колекция от култури и референтни геноми ще направи много по-евтино и по-лесно за изследователите да определят кои бактерии присъстват в общностите от хора и да изследват ролята им в болестите.
Д-р Роб Фин, автор от Европейския институт по биоинформатика на EMBL, каза: „За изследователите, които се опитват да разберат кои видове бактерии присъстват в микробиома на човек, базата данни с референтни геноми от чисти изолати на чревни бактерии е от решаващо значение След това, ако искат да тестват хипотеза, например, че определен вид е обогатен с определено заболяване, те могат да вземат самия изолат от колекцията и да тестват физически в лабораторията, ако този вид изглежда важен."
Д-р Тревър Лоули, старши автор от Wellcome Sanger Institute, каза: „Тази колекция от култури от отделни бактерии ще промени играта за основни и транслационни изследвания на микробиомите. Чрез култивиране на некултурните, ние създадохме ресурс, който ще направи анализа на микробиомите по-бърз, по-евтин и по-точен и ще позволи по-нататъшно изследване на тяхната биология и функции. В крайна сметка това ще ни насочи към разработването на нови диагностики и лечения за заболявания като стомашно-чревни разстройства, инфекции и имунни състояния.„
